1
TÍTULO: Correlating enzymatic reactivity for different substrates using transferable data- driven collective variables
AUTORES: Das, Sudip; Raucci, Umberto; Neves, Rui P. P. ; Ramos, Maria J.; Parrinello, Michele;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, VOLUME: 121, NÚMERO: 49
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2
TÍTULO: DszA Catalyzes C-S Bond Cleavage through N5-Hydroperoxyl Formation  Full Text
AUTORES: Pedro Ferreira ; Neves, Rui P. P. ; Miranda, Filipa P.; Cunha, Ana V.; Havenith, Remco W. A.; Ramos, Maria J.; Fernandes, Pedro A. ;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING, VOLUME: 64, NÚMERO: 10
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3
TÍTULO: QM/MM MD Study on the Reaction Mechanism of Thymidine Phosphorylation Catalyzed by the Enzyme Thermotoga maritima Thymidine Kinase 1
AUTORES: Makurat, Samanta; Neves, Rui P. P. ; Ramos, Maria J.; Rak, Janusz;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: ACS CATALYSIS, VOLUME: 14, NÚMERO: 13
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5
TÍTULO: Feedback Inhibition of DszC, a Crucial Enzyme for Crude Oil Biodessulfurization  Full Text
AUTORES: Neves, Rui P. P. ; Araujo, Bruno; Ramos, Maria J.; Fernandes, Pedro A. ;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: CATALYSTS, VOLUME: 13, NÚMERO: 4
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6
TÍTULO: How and When Does an Enzyme React? Unraveling alpha-Amylase Catalytic Activity with Enhanced Sampling Techniques
AUTORES: Das, Sudip; Raucci, Umberto; Neves, Rui P. P. ; Ramos, Maria J. J. ; Parrinello, Michele;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: ACS CATALYSIS, VOLUME: 13, NÚMERO: 12
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7
TÍTULO: Rate-enhancing PETase mutations determined through DFT/MM molecular dynamics simulations  Full Text
AUTORES: Jerves, Carola; Neves, Rui P. P. ; da Silva, Saulo L.; Ramos, Maria J. ; Fernandes, Pedro A. ;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: NEW JOURNAL OF CHEMISTRY, VOLUME: 48, NÚMERO: 1
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8
TÍTULO: Different Enzyme Conformations Induce Different Mechanistic Traits in HIV-1 Protease  Full Text
AUTORES: Coimbra, Joao T. S. ; Neves, Rui P. P. ; Cunha, Ana, V; Ramos, Maria J. ; Fernandes, Pedro A. ;
PUBLICAÇÃO: 2022, FONTE: CHEMISTRY-A EUROPEAN JOURNAL, VOLUME: 28, NÚMERO: 42
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef: 3
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9
TÍTULO: Engineering DszC Mutants from Transition State Macrodipole Considerations and Evolutionary Sequence Analysis  Full Text
AUTORES: Neves, Rui P. P. ; Ramos, Maria J. ; Fernandes, Pedro A. ;
PUBLICAÇÃO: 2022, FONTE: JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING, VOLUME: 63, NÚMERO: 1
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef: 4
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10
TÍTULO: Engineering of PKS Megaenzymes-A Promising Way to Biosynthesize High-Value Active Molecules  Full Text
AUTORES: Neves, Rui P. P. ; Ferreira, P; Medina, FE; Paiva, P ; Sousa, JPM; Viegas, MF; Fernandes, PA ; Ramos, MJ ;
PUBLICAÇÃO: 2022, FONTE: TOPICS IN CATALYSIS, VOLUME: 65, NÚMERO: 1-4
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef: 2
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