António José Meireles Ribeiro


AuthID: R-000-W64

Publicações Confirmadas: 39



11
TÍTULO: GRaSP: a graph-based residue neighborhood strategy to predict binding sites  Full Text
AUTORES: Charles A Santana; Sabrina de A Silveira; João P A Moraes; Sandro C Izidoro; Raquel C de Melo-Minardi; António J M Ribeiro ; Jonathan D Tyzack; Neera Borkakoti; Janet M Thornton;
PUBLICAÇÃO: 2020, FONTE: Bioinformatics, VOLUME: 36, NÚMERO: Supplement_2
INDEXADO EM: CrossRef: 8
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12
TÍTULO: Emerging concepts in pseudoenzyme classification, evolution, and signaling
AUTORES: António J M Ribeiro ; Sayoni Das; Natalie Dawson; Rossana Zaru; Sandra Orchard; Janet M Thornton; Christine Orengo; Elton Zeqiraj; James M Murphy; Patrick A Eyers;
PUBLICAÇÃO: 2019, FONTE: Science Signaling, VOLUME: 12, NÚMERO: 594
INDEXADO EM: CrossRef: 77
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13
TÍTULO: Exploring Chemical Biosynthetic Design Space with Transform-MinER
AUTORES: Jonathan D Tyzack; Antonio J M Ribeiro ; Neera Borkakoti; Janet M Thornton;
PUBLICAÇÃO: 2019, FONTE: ACS Synthetic Biology, VOLUME: 8, NÚMERO: 11
INDEXADO EM: CrossRef: 15
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14
TÍTULO: Identifying pseudoenzymes using functional annotation: pitfalls of common practice  Full Text
AUTORES: Antonio J M Ribeiro ; Jonathan D Tyzack; Neera Borkakoti; Janet M Thornton;
PUBLICAÇÃO: 2019, FONTE: The FEBS Journal, VOLUME: 287, NÚMERO: 19
INDEXADO EM: CrossRef: 19
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15
TÍTULO: PDBe-KB: a community-driven resource for structural and functional annotations  Full Text
AUTORES: Mihaly Varadi; John Berrisford; Mandar Deshpande; Sreenath S Nair; Aleksandras Gutmanas; David Armstrong; Lukas Pravda; Bissan Al-Lazikani; Stephen Anyango; Geoffrey J Barton; Karel Berka; Tom Blundell; Neera Borkakoti; Jose Dana; Sayoni Das; Sucharita Dey; Patrizio Di Micco; Franca Fraternali; Toby Gibson; Manuela Helmer-Citterich; David Hoksza; Liang-Chin Huang; Rishabh Jain; Harry Jubb; Christos Kannas; Natarajan Kannan; Jaroslav Koca; Radoslav Krivak; Manjeet Kumar; Emmanuel D Levy; Madeira, F; Madhusudhan, MS; Henry J Martell; Stuart MacGowan; Jake E McGreig; Saqib Mir; Abhik Mukhopadhyay; Luca Parca; Typhaine Paysan-Lafosse; Leandro Radusky; Antonio Ribeiro ; Luis Serrano; Ian Sillitoe; Gulzar Singh; Petr Skoda; Radka Svobodova; Jonathan Tyzack; Alfonso Valencia; Eloy Villasclaras Fernandez; Wim Vranken; Mark Wass; Janet Thornton; Michael Sternberg; Christine Orengo; Sameer Velankar; ...Mais
PUBLICAÇÃO: 2019, FONTE: Nucleic Acids Research, VOLUME: 48, NÚMERO: D1
INDEXADO EM: CrossRef: 80
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16
TÍTULO: Ranking Enzyme Structures in the PDB by Bound Ligand Similarity to Biological Substrates
AUTORES: Jonathan D Tyzack; Laurent Fernando; Antonio J.M Ribeiro ; Neera Borkakoti; Janet M Thornton;
PUBLICAÇÃO: 2018, FONTE: Structure, VOLUME: 26, NÚMERO: 4
INDEXADO EM: CrossRef: 23
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17
TÍTULO: Transform-MinER: transforming molecules in enzyme reactions  Full Text
AUTORES: Jonathan D Tyzack; Antonio J M Ribeiro ; Neera Borkakoti; Janet M Thornton;
PUBLICAÇÃO: 2018, FONTE: Bioinformatics, VOLUME: 34, NÚMERO: 20
INDEXADO EM: CrossRef: 10
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18
TÍTULO: Application of quantum mechanics/molecular mechanics methods in the study of enzymatic reaction mechanisms. Application of QM/MM methods  Full Text
AUTORES: Sérgio F. Sousa ; Ribeiro, AJM ; Neves, Rui P. P. ; Bras, NF ; Cerqueira, NMFSA ; Fernandes, PA ; Ramos, MJ ;
PUBLICAÇÃO: 2017, FONTE: WILEY INTERDISCIPLINARY REVIEWS-COMPUTATIONAL MOLECULAR SCIENCE, VOLUME: 7, NÚMERO: 2
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef: 124
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19
TÍTULO: Benchmarking of density functionals for the kinetics and thermodynamics of the hydrolysis of glycosidic bonds catalyzed by glycosidases. PEREIRA et al.  Full Text
AUTORES: Pereira, AT; Ribeiro, AJM ; Fernandes, PA ; Ramos, MJ ;
PUBLICAÇÃO: 2017, FONTE: INTERNATIONAL JOURNAL OF QUANTUM CHEMISTRY, VOLUME: 117, NÚMERO: 18
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef: 34
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20
TÍTULO: Binding free energy calculations on E-selectin complexes with sLe(x) oligosaccharide analogs  Full Text
AUTORES: Barra, PA; Ribeiro, AJM ; Ramos, MJ ; Jimenez, VA; Alderete, JB; Fernandes, PA ;
PUBLICAÇÃO: 2017, FONTE: CHEMICAL BIOLOGY & DRUG DESIGN, VOLUME: 89, NÚMERO: 1
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef: 7
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