1
TÍTULO: Toward Accurate pH-Dependent Binding Constant Predictions Using Molecular Docking and Constant-pH MD Calculations  Full Text
AUTORES: Yousef, Mohannad J.; Oliveira, Nuno F. B.; Vitorino, Joao N. M.; Reis, Pedro B. P. S.; Draczkowski, Piotr; Maj, Maciej; Jozwiak, Krzysztof; Machuqueiro, Miguel;
PUBLICAÇÃO: 2025, FONTE: JOURNAL OF CHEMICAL THEORY AND COMPUTATION, VOLUME: 21, NÚMERO: 5
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef
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2
TÍTULO: Adding the AMBER 14SB force field to the stochastic titration CpHMD method
AUTORES: João G N Sequeira; Adrian E Roitberg; Miguel Machuqueiro;
PUBLICAÇÃO: 2025
INDEXADO EM: CrossRef
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3
TÍTULO: Influence of Iodine Merz-Singh-Kollman Radius on the Calculated Charges and Hydration Free Energies of Iodinated Molecules
AUTORES: Fortuna, Andreia; Suzano, Pedro M. S.; Machuqueiro, Miguel; Costa, Paulo J.;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOPHYSICS AND CHEMISTRY, VOLUME: 23, NÚMERO: 04
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef
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4
TÍTULO: Dual FGFR-targeting and pH-activatable ruthenium-peptide conjugates for targeted therapy of breast cancer  Full Text
AUTORES: Machado, Joao Franco; Sa, Marco; Pires, Ines; da Silva, Miguel Tarita; Marques, Fernanda; Coelho, Jaime A. S.; Mendes, Filipa; Piedade, M. Fatima M.; Machuqueiro, Miguel; Jimenez, Maria Angeles; Garcia, Maria Helena; Correia, Joao D. G.; Morais, Tania S.;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: DALTON TRANSACTIONS, VOLUME: 53, NÚMERO: 18
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef
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5
TÍTULO: High Charge Density in Peptide Dendrimers is Required to Destabilize Membranes: Insights into Endosome Evasion
AUTORES: Rodrigues, Filipe E. P.; Darbre, Tamis; Machuqueiro, Miguel;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING, VOLUME: 64, NÚMERO: 8
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef: 1
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6
TÍTULO: PypKa server: online pKa predictions and biomolecular structure preparation with precomputed data from PDB and AlphaFold DB
AUTORES: Reis, Pedro B. P. S.; Clevert, Djork Arne; Machuqueiro, Miguel;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: NUCLEIC ACIDS RESEARCH, VOLUME: 52, NÚMERO: W1
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef
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7
TÍTULO: Is There a Functional Role for the Knotted Topology in Protein UCH-L1?
AUTORES: Ferreira, Sara G. F.; Sriramoju, Manoj K.; Hsu, Shang Te Danny; Faisca, Patricia F. N.; Machuqueiro, Miguel;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef
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8
TÍTULO: pK a Calculations of GPCRs: Understanding Protonation States in Receptor Activation  Full Text
AUTORES: Barreto, Carlos A. V.; Vitorino, Joao N. M.; Reis, Pedro B. P. S.; Machuqueiro, Miguel; Moreira, Irina S.;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING
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9
TÍTULO: A novel combinatory treatment against a CDDP-resistant non-small cell lung cancer based on a Ruthenium(II)-cyclopentadienyl compound
AUTORES: Salaroglio, Iris C.; Stefanova, Denitsa; Teixeira, Ricardo G.; Oliveira, Nuno F. B.; Ahmed, Amer; Fusi, Fabio; Tzankova, Virginia; Yordanov, Yordan; Machuqueiro, Miguel; Saponara, Simona; Valente, Andreia; Riganti, Chiara;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: PHARMACOLOGICAL RESEARCH, VOLUME: 208
INDEXADO EM: Scopus WOS
10
TÍTULO: Constant-pH MD simulations of the protonation-triggered conformational switching in diphtheria toxin translocation domain
AUTORES: Oliveira, Nuno F. B.; Ladokhin, Alexey S.; Machuqueiro, Miguel;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: BIOPHYSICAL JOURNAL, VOLUME: 123, NÚMERO: 24
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