Rui Manuel Freitas Oliveira
AuthID: R-000-FXV
1
TÃTULO: Deep hybrid modeling of a HEK293 process: Combining long short-term memory networks with first principles equations Full Text
AUTORES: Ramos, Joao R. C.; Pinto, Jose; Gil Poiares-Oliveira ; Peeters, Ludovic; Dumas, Patrick; Oliveira, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: BIOTECHNOLOGY AND BIOENGINEERING, VOLUME: 121, NÚMERO: 5
AUTORES: Ramos, Joao R. C.; Pinto, Jose; Gil Poiares-Oliveira ; Peeters, Ludovic; Dumas, Patrick; Oliveira, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: BIOTECHNOLOGY AND BIOENGINEERING, VOLUME: 121, NÚMERO: 5
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TÃTULO: SBML2HYB: a Python interface for SBML compatible hybrid modeling
AUTORES: Pinto, Jose; Costa, Rafael S.; Alexandre, Leonardo; Ramos, Joao; Oliveira, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: BIOINFORMATICS, VOLUME: 39, NÚMERO: 1
AUTORES: Pinto, Jose; Costa, Rafael S.; Alexandre, Leonardo; Ramos, Joao; Oliveira, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: BIOINFORMATICS, VOLUME: 39, NÚMERO: 1
3
TÃTULO: A General Hybrid Modeling Framework for Systems Biology Applications: Combining Mechanistic Knowledge with Deep Neural Networks under the SBML Standard
AUTORES: Pinto, Jose; Ramos, Joao R. C.; Costa, Rafael S.; Oliveira, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: AI, VOLUME: 4, NÚMERO: 1
AUTORES: Pinto, Jose; Ramos, Joao R. C.; Costa, Rafael S.; Oliveira, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: AI, VOLUME: 4, NÚMERO: 1
4
TÃTULO: Hybrid Deep Modeling of a GS115 (Mut+) Pichia pastoris Culture with State-Space Reduction
AUTORES: Pinto, Jose; Ramos, Joao R. C.; Costa, Rafael S.; Oliveira, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: FERMENTATION-BASEL, VOLUME: 9, NÚMERO: 7
AUTORES: Pinto, Jose; Ramos, Joao R. C.; Costa, Rafael S.; Oliveira, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: FERMENTATION-BASEL, VOLUME: 9, NÚMERO: 7
5
TÃTULO: Upcycling of food waste streams to valuable biopigments pyocyanin and 1-hydroxyphenazine Full Text
AUTORES: Pantelic, Lena; Bogojevic, Sanja Skaro; Vojnovic, Sandra; Oliveira, Rui; Lazic, Jelena; Ilic Tomic, Tatjana; Milivojevic, Dusan; Nikodinovic Runic, Jasmina;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: ENZYME AND MICROBIAL TECHNOLOGY, VOLUME: 171
AUTORES: Pantelic, Lena; Bogojevic, Sanja Skaro; Vojnovic, Sandra; Oliveira, Rui; Lazic, Jelena; Ilic Tomic, Tatjana; Milivojevic, Dusan; Nikodinovic Runic, Jasmina;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: ENZYME AND MICROBIAL TECHNOLOGY, VOLUME: 171
INDEXADO EM: 
Scopus 
WOS
Scopus WOS6
TÃTULO: From Shallow to Deep Bioprocess Hybrid Modeling: Advances and Future Perspectives
AUTORES: Agharafeie, Roshanak; Ramos, Joao Rodrigues Correia; Mendes, Jorge M.; Oliveira, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: FERMENTATION-BASEL, VOLUME: 9, NÚMERO: 10
AUTORES: Agharafeie, Roshanak; Ramos, Joao Rodrigues Correia; Mendes, Jorge M.; Oliveira, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: FERMENTATION-BASEL, VOLUME: 9, NÚMERO: 10
7
TÃTULO: A General SBML Compatible Hybrid Modeling Framework: Combining Biochemical Mechanisms with Deep Neural Networks for Systems Biology Applications
AUTORES: José Pinto; João R C Ramos; Rafael S Costa; Rui Oliveira;
PUBLICAÇÃO: 2023
AUTORES: José Pinto; João R C Ramos; Rafael S Costa; Rui Oliveira;
PUBLICAÇÃO: 2023
8
TÃTULO: From Shallow to Deep Bioprocess Hybrid Modeling: Advances and Future Perspectives
AUTORES: Roshanak Agharafeie; João Rodrigues Correia Ramos; Jorge M Mendes; Rui Oliveira;
PUBLICAÇÃO: 2023
AUTORES: Roshanak Agharafeie; João Rodrigues Correia Ramos; Jorge M Mendes; Rui Oliveira;
PUBLICAÇÃO: 2023
9
TÃTULO: Indole-Containing Pyrazino[2,1-b]quinazoline-3,6-diones Active against Plasmodium and Trypanosomatids
AUTORES: Long, S; Duarte, D; Carvalho, C; Oliveira, R; Santarem, N; Palmeira, A ; Resende, DISP; Silva, AMS; Moreira, R; Kijjoa, A; da Silva, AC ; Nogueira, F; Sousa, E ; Pinto, MMM;
PUBLICAÇÃO: 2022, FONTE: ACS MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS, VOLUME: 13, NÚMERO: 2
AUTORES: Long, S; Duarte, D; Carvalho, C; Oliveira, R; Santarem, N; Palmeira, A ; Resende, DISP; Silva, AMS; Moreira, R; Kijjoa, A; da Silva, AC ; Nogueira, F; Sousa, E ; Pinto, MMM;
PUBLICAÇÃO: 2022, FONTE: ACS MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS, VOLUME: 13, NÚMERO: 2
10
TÃTULO: A general deep hybrid model for bioreactor systems: Combining first principles with deep neural networks
AUTORES: Pinto, Jose; Mestre, Mykaella; Ramos, J.; Costa, Rafael S.; Striedner, Gerald; Oliveira, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2022, FONTE: COMPUTERS & CHEMICAL ENGINEERING, VOLUME: 165
AUTORES: Pinto, Jose; Mestre, Mykaella; Ramos, J.; Costa, Rafael S.; Striedner, Gerald; Oliveira, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2022, FONTE: COMPUTERS & CHEMICAL ENGINEERING, VOLUME: 165
