1
TÍTULO: Reactivation of a Transplant Recipient's Inherited Human Herpesvirus 6 and Implications to the Graft
AUTORES: Hannolainen, Leo; Pyoria, Lari; Pratas, Diogo; Lohi, Jouko; Skuja, Sandra; Rasa Dzelzkaleja, Santa; Murovska, Modra; Hedman, Klaus; Jahnukainen, Timo; Perdomo, Maria Fernanda;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: JOURNAL OF INFECTIOUS DISEASES
INDEXADO EM: WOS CrossRef: 1
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2
TÍTULO: Intra-host genomic diversity and integration landscape of human tissue-resident DNA virome  Full Text
AUTORES: Pyoria, Lari; Pratas, Diogo; Toppinen, Mari; Simmonds, Peter; Hedman, Klaus; Sajantila, Antti; Perdomo, Maria F.;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: NUCLEIC ACIDS RESEARCH, VOLUME: 52, NÚMERO: 21
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef
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3
TÍTULO: A sensitive compression-based method for filtering targeted FASTQ sequencing reads
AUTORES: Sousa, Maria J. P.; Pinho, Armando J.; Pratas, Diogo;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: 32nd European Signal Processing Conference (EUSIPCO) in 32ND EUROPEAN SIGNAL PROCESSING CONFERENCE, EUSIPCO 2024
INDEXADO EM: Scopus WOS DBLP
4
TÍTULO: Improving the generation of viral consensus sequences using adaptive models
AUTORES: Sousa, Maria J. P.; Pinho, Armando J.; Pratas, Diogo;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: 32nd European Signal Processing Conference (EUSIPCO) in 32ND EUROPEAN SIGNAL PROCESSING CONFERENCE, EUSIPCO 2024
INDEXADO EM: Scopus WOS DBLP
5
TÍTULO: Machine Learning-Driven Discovery and Database of Cyanobacteria Bioactive Compounds: A Resource for Therapeutics and Bioremediation  Full Text
AUTORES: Soares, Renato; Azevedo, Luisa; Vasconcelos, Vitor; Pratas, Diogo; Sousa, Sergio F.; Carneiro, Joao;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef
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6
TÍTULO: AltaiR: a C toolkit for alignment-free and temporal analysis of multi-FASTA data  Full Text
AUTORES: Silva, Jorge M.; Pinho, Armando J.; Pratas, Diogo;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: GIGASCIENCE, VOLUME: 13
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef
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7
TÍTULO: JARVIS3: an efficient encoder for genomic data  Full Text
AUTORES: Sousa, Maria J. P.; Pinho, Armando J.; Pratas, Diogo;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: BIOINFORMATICS, VOLUME: 40, NÚMERO: 12
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef
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TÍTULO: Herpesviruses, polyomaviruses, parvoviruses, papillomaviruses, and anelloviruses in vestibular schwannoma
AUTORES: Jauhiainen, Maria K.; Mohanraj, Ushanandini; Lehecka, Martin; Niemela, Mika; Hirvonen, Timo P.; Pratas, Diogo; Perdomo, Maria F.; Soderlund Venermo, Maria; Makitie, Antti A.; Sinkkonen, Saku T.;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: JOURNAL OF NEUROVIROLOGY, VOLUME: 29, NÚMERO: 2
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef: 1
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TÍTULO: TargIDe: a machine -learning workflow for target identification of molecules with antibiofilm activity against<i> Pseudomonas</i> aeruginosa  Full Text
AUTORES: Carneiro, Joao; Magalhaes, Rita P.; Roque, Victor de la Oliva M.; Simoes, Manuel; Pratas, Diogo; Sérgio F. Sousa ;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: JOURNAL OF COMPUTER-AIDED MOLECULAR DESIGN, VOLUME: 37, NÚMERO: 5-6
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef: 5
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10
TÍTULO: Mapping human pathogens in wastewater using a metatranscriptomic approach  Full Text
AUTORES: Carneiro, Joao; Pascoal, Francisco; Semedo, Miguel; Pratas, Diogo; Tomasino, Maria Paola; Rego, Adriana; Carvalho, Maria de Fatima; Mucha, Ana Paula ; Magalhaes, Catarina ;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: ENVIRONMENTAL RESEARCH, VOLUME: 231
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef: 2
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